肿瘤新生抗原与抗体发现
结合蛋白质组学与NGS技术,进行MHC呈递新生抗原鉴定和抗体CDR蛋白测序,支持肿瘤免疫治疗和抗体药物开发。
肿瘤新生抗原与抗体发现蛋白质组分析服务
Neoantigen 肿瘤新生抗原分析
肿瘤细胞的遗传不稳定常导致大量突变,非同义突变的表达可产生肿瘤特异性抗原,称为新生抗原(Neoantigen)。部分新生抗原可在细胞表面表达、加工和呈现,随后在MHC分子的作用下被T细胞识别。新生抗原是基于T细胞的癌症免疫治疗的理想靶点,也可为肿瘤治疗性疫苗的设计提供重要信息。 传统方式将cDNA文库和MHC分子在细胞系中过量表达后与T细胞共培养,费时费力且效率低下。DeepKinase将高分辨质谱蛋白质组学技术与NGS测序技术结合,通过富集MHC I类或II类蛋白及其呈递的多肽,进行质谱采集后直接鉴定肿瘤新生抗原,大幅提升鉴定效率和准确性。
MHC I/II 类分子呈递多肽富集
质谱直接鉴定新生抗原肽序列
蛋白质组学 + NGS 联合分析
支持肿瘤疫苗和免疫治疗开发
抗体 CDR 蛋白质组学测序
传统抗体药物先导分子筛选以杂交瘤筛选、噬菌体/酵母展示库筛选和单细胞筛选为主,筛选过程费时且低效。DeepKinase与合作伙伴共同提供基于质谱蛋白质组学、NGS测序和生物信息学算法的抗体药物筛选平台,可快速高效地筛选亲和力高、可开发性强的抗体。 该平台通过高分辨质谱直接对抗体蛋白进行de novo测序,精确定位CDR区域序列,无需传统杂交瘤或展示库筛选步骤。在此基础上,利用DeepK®大数据和AI算法,可设计出更优的先导分子用于下一步药物开发。
质谱 de novo 抗体蛋白测序
CDR 区域精确定位
无需杂交瘤/展示库筛选
AI 辅助先导分子优化设计